но проблема в том что в расширении есть реквизит, который содержит данные (мне их сохранять не нужно), и удаление не возможно. Можно конечно вручную это всё делать, но это 90 распределённых баз.
(0) В центральном узле внесите нужные Вам изменения в расширение; отключите расширение; передайте сообщениями обмена это по всем узлам; после миграции по всем узлам - можно удалить расширение в центральном узле. Для этих действий использование командной строки не требуется - весь необходимый функционал присутствует в конфигурации (должен присутствовать).
Было бы неплохо очистить ненужные данные перед удалением реквизита.
Требовать и эффективности, и гибкости от одной и той же программы — все равно, что искать очаровательную и скромную жену... по-видимому, нам следует остановиться на чем-то одном из двух. Фредерик Брукс-младший