Регистр Товары на склада. Какого то числа по этому регистру сделали расход, при котором остатки на складе ушли в минус. Но потом сделали приход и все стало нормально. Как запросом можно найти все такие моменты когда остатки уходили в минус??

Нужно не допускать такой ситуации

(1) ну как есть. Вроде разобрался. Взять регистрОстаткиИОбороты и сделать переодичность по записи. Наверное так... хотя может ошибаюсь

можно до регистратора

Выполнять запрос остатков в цикле увеличения дат за определённый период. Например, с 01/10/2013 до 18/10/2013 с шагом 1 день или 1 минута - долго и ресурсоёмко, но если надо придётся ждать.