Здравствуйте,
Постановка проблемы:
В КА переносятся вручную данные из другой программы по зп. Будет ли у меня корректно считаться больничные, отпускные и пр.  если не вводить детально (с помесячной детализацией) начисления и выплаты за два предыдущих года  (с 01.01.2009), а указать их одной суммой за год, например, зарегистрировать их как заработок у других страхователей, или внести приход и расход в документе "перенос данных" по регистрам "зп к выплате орг", "взоиморасчеты с сотрудниками орг" и "НДФЛ расчет с бюджетом" общей суммой за 09 и 10 год соответственно?

(0) не будут

Помимо ввода документов начисления и выплаты зарплаты есть другие, менее трудоемкие и корректные варианты ввода этой информации?

(2) ага, есть. написать перенос ;)